Publisher's Synopsis
Niedawne postepy w technologiach sekwencjonowania nowej generacji (NGS) skrócily czas potrzebny na identyfikacje mutacji w genetyce wyprzedzajacej, jednym z glównych sposobów charakteryzowania funkcji genów u roslin. Metodologia stosowana do identyfikacji mutacji indukowanych przez mutageny fizyczne lub chemiczne w populacji mapujacej jest znana jako mapowanie przez sekwencjonowanie. Wsród róznych technik wykorzystujacych te metodologie wyróznia sie mapowanie nowej generacji (NGM), poniewaz wymaga niewielkiej liczby mutantów w populacji mapujacej. Jednak w opublikowanych pracach nie jest jasne, dlaczego parametry uzyte do utworzenia populacji mapujacej (liczba osobników, liczba mutantów, sposób krzyzowania) i do sekwencjonowania (zastosowana platforma, metoda sekwencjonowania, pokrycie) zostaly wykorzystane w eksperymentach. Z tego powodu opracowano potok bioinformatyczny, który umozliwia symulacje danych z eksperymentów wykorzystujacych technike NGM z modelowa roslina Arabidopsis thaliana, jedna z najczesciej badanych i sekwencjonowanych roslin w literaturze.
